Szkoła Podstawowa nr 39 realizuje następujące projekty:
1. Projekt „Kompleksowa termomodernizacja budynku placówki oświatowej”;
2. Projekt „Rozwój elektronicznych usług publicznych w Gdyni”;
3. Projekt „Praktyka czyni mistrza – nowatorski program praktyk na studiach pedagogicznych
PWSNPS”;
4. Projekt „Pracownie komputerowe dla szkół”.
-*-*-*-*-*-*-*-*-*-*
W roku szkolnym 2020/21 nasza szkoła kontynuuje realizację projektu Deutsch Plus koordynowanego przez Instytut Goethego w Warszawie. W ramach projektu uczniowie zostali zaproszeni na koncert Rogera Reclesa, który odbył się w Gdyni 2 października 2019 r., będą mogli między innymi brać udział w ogólnopolskich konkursach z atrakcyjnymi nagrodami, brać udział w warsztatach prowadzonych przez lektorów z Instytutu Goethego na temat Umweltschutz (ochrona środowiska), otrzymają zniżki przy przystąpieniu do egzaminów Goethe-Institut z możliwością przeprowadzenia ich bezpośrednio w szkole.